故事的情景发生在2065年的地球上，此时，毁灭和混乱包围着人类。城市被废弃，人类大量地被涂炭，那些幸运活下来的人们则努力寻找一条生存之计。一场来自外星人的侵略威胁着地球上的幸存者，并将很可能灭绝这个星球上所有的生物。地球上所有人的命运掌握在一个女人的手中，但是时间正在流逝。



希望只有一个——艾琪·罗斯（Aki Ross）在她的母亲西德博士（Dr.Sid）的指导下，依靠“深眼骑兵队”（Deep Eyes squadron）的帮助，正在寻找一种精神冲击波。这是唯一的在不摧毁这个星球的前提下与外星人入侵作斗争的希望所在。



最终，被一个外星人感染的艾琪掌握了击败外星人的秘密。但是她遇到了好战的海因将军（General Hein）的强烈反对。他正密谋发射一种大规模的空间炮，此举将在消灭外星人的同时很可能将地球也一起毁灭掉，艾琪·罗斯的努力也将难有结果。



在这个世界上，当我们离开自己所爱的人时将不得不面对死亡的威胁。我们需要开始反思“生命”和“爱”究竟意味着什么？“心”的哲学含义又该如何表述？毕竟在这个世界上，科学已充分诠释了什么是生命，什么是死亡，生命只不过是能量的一种表现形式而已。



时间在分分秒秒地过去，艾琪在她的梦境中寻找着外星人秘密的答案，同时她确信她所搜集的8种精神波能够消除地球所面临的威胁，拯救这个星球。



除了精彩的战争场面之外，《最终幻想》将带你进入一个在现实生活和幻想世界中风格独特的旅程，以其人物塑造和主题——爱情、友谊、梦境、冒险、生命和死亡——深深地吸引你。



通过与外星人作战和诡计多端的海因将军的斗智斗勇，艾琪为了拯救行将毁灭的地球，勇敢地追求着她的“最终幻想”。